BRCA1, BRCA2, PALB2 – badanie najczęstszych mutacji w populacji polskiej metodą NGS (HotSpot)

Analiza wykonywana jest metodą NGS (sekwencjonowania nowej generacji) w technologii HotSpot i obejmuje:

BRCA1 – 15 wariantów:
c.66_67insTC (rs1555600909), c.68_69del (rs80357914), c.181T>G/C/A (rs28897672), c.190T>G/C/A (rs80357064), c.3627dup (rs80357729), c.3700_3704del (rs80357609; dawna nazwa: c.3819del5), c.3748G>T/A (rs28897686), c.3756_3759del (rs80357868; dawna nazwa: c.3875del4), c.3779del (rs80357798), c.3817C>T (rs80357208), c.4035del (rs80357711; dawna nazwa: c.4153delA), c.4041_4042del (rs80357727), c.5232_5238delinsGTCCAAAGCGAG (rs483353071), c.5251C>T/G/A (rs80357123), c.5266dup (rs80357906; dawna nazwa: c.5382insC).

BRCA2 – 4 warianty:
c.5946del (rs80359550; dawna nazwa: c.6174delT), c.9371A>T/G (rs28897759), c.9376del (rs398122612), c.9403del (rs80359760).

PALB2 – 2 warianty:
c.509_510del, c.172_175del.

Badanie pozwala na identyfikację nosicielstwa wybranych wariantów związanych ze zwiększonym ryzykiem rozwoju nowotworów dziedzicznych.

Zastosowanie badania

Badanie znajduje zastosowanie w następujących sytuacjach:

• ocena dziedzicznej predyspozycji do raka piersi i jajnika;
• ocena predyspozycji do innych nowotworów związanych z genami BRCA1, BRCA2 i PALB2, w tym raka prostaty i trzustki;
• diagnostyka osób z obciążonym wywiadem rodzinnym w kierunku nowotworów;
• badania przesiewowe u krewnych osób z rozpoznaną dziedziczną predyspozycją nowotworową;
• wsparcie poradnictwa genetycznego oraz planowania indywidualnej profilaktyki i monitorowania onkologicznego.

Uwagi dotyczące interpretacji wyniku

Badanie ma charakter przesiewowy i obejmuje wyłącznie 21 określonych wariantów w genach BRCA1, BRCA2 i PALB2. Wynik ujemny nie wyklucza dziedzicznej predyspozycji do nowotworów, ponieważ w genach tych mogą występować inne warianty patogenne niewchodzące w zakres badania, a predyspozycja może być związana również z innymi genami.

W przypadku silnego obciążenia osobistego lub rodzinnego chorobami nowotworowymi, pomimo uzyskania wyniku ujemnego, zasadne może być wykonanie szerszego badania obejmującego wielogenowego panelu predyspozycji nowotworowych (NOW-NGS) w tym pełne sekwencje kodujące genów BRCA1, BRCA2, PALB2. Wynik powinien być interpretowany w kontekście obrazu klinicznego i wywiadu rodzinnego przez lekarza prowadzącego lub specjalistę genetyki klinicznej.

Badanie nie jest przeznaczone dla dzieci poniżej 16 roku życia. W przypadku badania dzieci powyżej 16 roku życia, oprócz zgody pacjenta, wymagana jest zgoda rodzica lub opiekuna prawnego oraz skierowanie od lekarza specjalisty.

Europejskie Towarzystwo Genetyki Człowieka (European Society of Human Genetics, ESHG) zaleca, aby badania predyspozycji do rozwoju nowotworów i niektórych chorób neurodegeneracyjnych odłożyć do czasu, aż osoba uzyska pełnoletność i sama podejmie świadomą decyzję, dotyczącą zakresu wiedzy o swoich predyspozycjach genetycznych. Dotyczy to informacji o ryzyku zachorowania na choroby, które ujawniają się w wieku dorosłym i nie stosuje się wobec nich żadnych działań profilaktycznych przed uzyskaniem pełnoletności. Przeprowadzenie badań genetycznych u nieletnich w kierunku chorób ujawniających się w dzieciństwie jest w pełni uzasadnione w przypadku schorzeń, które można skutecznie leczyć lub objąć natychmiastową profilaktyką.