Profilowanie tkanki nowotworowej metodą NGS

Panele somatyczne NGS – opis badania Badanie NGS (ang. Next-Generation Sequencing) umożliwia jednoczesną analizę wielu genów istotnych w diagnostyce i leczeniu nowotworów. Poniżej przedstawiono listy genów uwzględniane w dedykowanych panelach somatycznych dla poszczególnych typów nowotworów. Wszystkie panele analizowane są w ramach jednego badania, a raportowane oddzielnie w zależności od rodzaju nowotworu. Rak jajnika AKT1, ARID1A, ATM, BRAF, BRCA1, BRCA2, CDKN2A, CHEK2, CTNNB1, EGFR, EPCAM, KRAS, MLH1, MSH2, MSH6, NRAS, NTRK1/2/3, PALB2, PARP1, PIK3CA, PMS2, POLE, PTEN, RAD51C, RAD51D, TP53 Rak jelita AKT1, APC, ARID1A, BRAF, CHEK2, CTNNB1, EGFR, ERBB2, KRAS, MET, MLH1, MSH2, MSH6, NRAS, PMS2, POLE, PTEN, SMAD4, TP53 Rak endometrium AKT1, ARID1A, BRAF, BRCA1, BRCA2, CHEK2, CTNNB1, EPCAM, FGFR2, KRAS, MLH1, MSH2, MSH6, NRAS, PIK3CA, PMS2, POLE, PTEN, TP53 Rak piersi AKT1, ARID1A, BRAF, BRCA1, BRCA2, CD4, CDK6, CHEK2, ERBB2, ESR1, FGFR1, FGFR2, GATA3, KRAS, NTRK1/2/3, PIK3CA, PTEN, RAD51C, RAD51D, TP53 Rak prostaty ATM, ATR, BRAF, BRCA1, BRCA2, CDK12, CHEK2, FANCA, FANCL, MLH1, MSH2, MSH6, PALB2, PMS2, PTEN, RAD51C, RAD51D, TP53 Rak trzustki ARID1A, BRAF, BRCA1, BRCA2, CDK12, CDKN2A, EPCAM, ERBB2, FGFR2, KRAS, MLH1, MSH2, MSH6, NRAS, PALB2, PMS2, SMAD4, TP53 Rak żołądka ARID1A, BRAF, BRCA1, BRCA2, CDH1, CDKN2A, CHEK2, EGFR, ERBB2, ERBB3, FGFR2, KRAS, MET, MLH1, MSH2, MSH6, NRAS, PALB2, PMS2, PIK3CA, TP53 Rak tarczycy BRAF, HRAS, KRAS, NRAS, RET, NTRK1/2/3, TP53, PIK3CA, PTEN, AKT1 Czerniaki BRAF, CDKN2A, CTNNB1, GNA11, GNAQ, KIT, MAPK2, NF1, NRAS, NTRK1/2/3, PIK3CA, PTEN, TERT, TP53 Nowotwory mózgu ATR, EGFR, IDH1, IDH2, NF1, NF2, SMARCA4, SMARCB1, TERT, TP53 Pełny panel somatyczny (NGS) AKT1, APC, ARID1A, ATM, ATR, BRAF, BRCA1, BRCA2, CD4, CDH1, CDK12, CDK6, CDKN2A, CHEK2, CTNNB1, EGFR, EPCAM, ERBB2, ERBB3, ESR1, FANCA, FANCL, FGFR1, FGFR2, GATA3, GNA11, GNAQ, HRAS, IDH1, IDH2, KIT, KRAS, MAPK2, MET, MLH1, MSH2, MSH6, NF1, NF2, NRAS, NTRK1/2/3, PALB2, PARP1, PIK3CA, PMS2, POLE, PTEN, RAD51C, RAD51D, RET, SMAD4, SMARCA4, SMARCB1, STK11, TERT, TP53